La Gerencia es el órgano responsable de la gestión económica y administrativa para el correcto funcionamiento del IGME, asumiendo la asistencia precisa para la eficiente utilización de los medios y recursos materiales, económicos y personales que tenga asignados.

Son funciones de la Gerencia, entre otras:

1. La gestión económica y administrativa de los servicios generales, de las compras, de la contratación de obras y servicios externos.
2. La elaboración de la propuesta del presupuesto del instituto y su liquidación, así como su ejecución de acuerdo a sus competencias, siguiendo las directrices de la dirección del instituto.
3. La gestión económica y de personal de acuerdo a sus competencias.
4. La dirección funcional del personal en lo que se refiere a su régimen administrativo y la supervisión de todas las unidades de servicios administrativos y generales.
5. La coordinación del mantenimiento y la seguridad de la sede, unidades territoriales e infraestructuras del IGME, así como la garantía de operatividad del equipamiento y las infraestructuras científicas, en coordinación con la vicedirección técnica.
6. La gestión y control del acceso y permanencia en los espacios e instalaciones del IGME del personal adscrito, así como del personal temporal y externo, siguiendo las directrices de la dirección del instituto.
7. El control del inventario de los bienes que tenga adscrito el IGME y su gestión, de acuerdo con sus competencias.
8. La gestión de la prevención de riesgos laborales, incluyendo los mecanismos de “coordinación de actividades empresariales” (CAE) con terceras entidades.
9. La coordinación de los servicios TIC de carácter horizontal del IGME, siguiendo las directrices de la Secretaría General Adjunta de Informática.

La Gerencia del IGME cuenta con las siguientes Unidades:

• Unidad económica y contratación
• Unidad de personal
• Unidad de coordinación e infraestructuras
• Unidad de apoyo informático.