La Litoteca es una infraestructura científico-técnica creada por el IGME en 1988. Se trata del único centro a nivel nacional de acceso público, donde se preservan y custodian testigos, ripios y muestras pétreas. Igualmente, se conserva un importante fondo documental con la información geológica y minera generada en el desarrollo de las campañas de exploración e investigación de recursos geológicos y yacimientos minerales llevadas a cabo, tanto por el IGME como por otras entidades públicas o privadas, en el territorio nacional, mar territorial y plataforma continental.

La Litoteca tiene como misión la gestión, catalogación, digitalización de las colecciones científicas que conserva, proporcionando ayuda y asesoramiento técnico para el estudio y muestreo de dichas colecciones.

La Litoteca dispone de la infraestructura necesaria para el estudio de sondeos, taller de testificación, maquinaria para el corte de rocas y testigos, microscopios petrográficos y lupas binoculares.

Se encuentra también equipada con una plataforma multisensorial Box Scan de análisis de testigos y muestras de roca (FRX, análisis VNIR/SWIR, susceptibilidad magnética y perfilador láser), un escáner de testigos DMT Corescan Colour II y software DigiCore y dos analizadores portátiles de FRX para el estudio de la composición química in situ. Todos estos equipos permiten hacer determinaciones de forma no destructiva.